HOMD ::Genus:Enterococcus

Taxonomy: V4.1 | 16S rRNA RefSeq: V16.03 | Genomic RefSeq: V11.02 | Viruses: V1.2

Genus: Enterococcus

Download Options

Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Bacilli; Lactobacillales; Enterococcaceae; Enterococcus Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

Lower rank member(s): [Species:Enterococcus casseliflavus] [Species:Enterococcus durans] [Species:Enterococcus faecalis] [Species:Enterococcus italicus] [Species:Enterococcus saccharolyticus]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Enterococcus

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.007	0.000	0.000	0.033	0.000	0.000	0.014	0.645
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	1.741
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.057	0.000	0.000	0.152	0.000	0.000	0.111	2.355
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	4.310	0.000	0.000	9.217	0.000	0.000	2.632	50.980

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.012	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.126	0.059	0.000	0.090	0.081	0.000	0.000	0.016	1.482
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.058
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.126	0.015	0.000	0.077	0.063	0.000	0.000	0.000	3.581
Stdev	0.000	0.000	0.071	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.806	0.415	0.000	0.356	0.354	0.000	0.000	0.119	2.808
Prev(%)	0.000	0.000	5.679	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	26.820	12.739	0.000	15.172	14.000	0.000	0.000	6.283	95.620

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	2.941	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.006	0.010	0.000	0.000	0.000	0.000	0.002	0.001
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.001	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.087	0.051	0.000	0.000	0.000	0.000	0.022	0.012
Prev(%)	0.000	0.758	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.901	4.167	0.000	0.000	0.000	0.000	1.010	2.727

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes