HOMD ::Genus:Lachnospiraceae [G3]

Genus: Lachnospiraceae [G3]

Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Clostridia; Lachnospirales; Lachnospiraceae; Lachnospiraceae [G3] Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

Lower rank member(s): [Species:Lachnospiraceae [G3] bacterium HMT-100]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Lachnospiraceae [G3]

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

Eren V1-V3 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.115	0.129	0.004	0.022	0.032	0.053	0.059	0.069	0.038	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.322	0.432	0.000	0.073	0.091	0.128	0.082	0.168	0.109	0.000
Stdev	0.164	0.216	0.018	0.043	0.094	0.166	0.216	0.216	0.106	0.000
Prev(%)	61.039	50.649	7.792	38.961	36.364	29.870	23.377	40.260	22.078	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.125	0.172	0.003	0.029	0.042	0.078	0.115	0.138	0.071	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.363	0.496	0.000	0.098	0.137	0.245	0.300	0.392	0.147	0.000
Stdev	0.173	0.271	0.012	0.067	0.101	0.185	0.338	0.427	0.207	0.000
Prev(%)	64.865	64.189	8.784	29.730	31.081	38.514	31.081	39.865	29.054	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V1-V3) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.084	0.098	0.000	0.018	0.025	0.038	0.059	0.056	0.041	0.000	0.000	0.000	0.000	0.004	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.237	0.249	0.000	0.055	0.069	0.068	0.158	0.130	0.032	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.156	0.212	0.000	0.044	0.078	0.135	0.192	0.186	0.161	0.000	0.000	0.000	0.000	0.032	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	61.589	54.305	0.000	34.932	28.859	25.385	23.810	34.667	23.871	0.000	0.000	0.000	0.000	3.226	0.000	0.000	0.000	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V3-V5) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.129	0.141	0.000	0.000	0.000	0.000	0.102	0.113	0.064	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.404	0.445	0.000	0.000	0.000	0.000	0.262	0.309	0.107	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.211	0.240	0.000	0.000	0.000	0.000	0.347	0.329	0.218	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	64.691	60.732	0.000	0.000	0.000	0.000	24.922	38.929	25.791	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.110	0.209	0.030	0.028	0.025	0.023	0.065	0.052	0.057	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.326	0.519	0.099	0.078	0.028	0.088	0.243	0.045	0.106	0.000
Stdev	0.255	0.432	0.050	0.045	0.072	0.043	0.131	0.147	0.173	0.000
Prev(%)	63.514	70.588	62.791	57.143	60.714	58.000	48.485	41.935	35.000	0.000

Human Microbiome Project Metaphlan (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: