HOMD ::genus::Parvimonas

HOME
Taxonomy
Genomes
Proteomes
16S rRNA Microbiome
Animal Microbiomes
- Mouse (MOMD)
Downloads
- Download Batch HOMD Data
- HOMD FTP Site
Resources/Tools
About Us

Taxonomy: V4.0 | 16S rRNA RefSeq: V16.02 | Genomic RefSeq: V11.01

Genus: Parvimonas

Download Options

Each rank name is a link to abundance plots at that rank:
Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Clostridia; Tissierellales; Peptoniphilaceae; Parvimonas
Lower rank member(s): [Species:Parvimonas micra] [Species:Parvimonas sp. HMT-110] [Species:Parvimonas sp. HMT-393]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Parvimonas

Oral:	SUBP-- Subgingival Plaque	SUPP -- Supragingival Plaque	PERIO -- Periodontal	AKE -- Attached Keratinized Gingiva	BMU -- Buccal Mucosa
Oral:	HPA -- Hard Palate	SAL -- Saliva	THR -- Throat	PTO -- Palatine Tonsils	TDO -- Tongue Dorsum
Nasal:	ANA -- Anterior Nares
Skin:	LRC -- L_Retroauricular Crease	RRC -- R_Retroauricular Crease	LAF -- L_Antecubital Fossa	RAF -- R_Antecubital Fossa
Vaginal:	VIN -- Vaginal Introitus	MVA -- Mid Vagina	PFO -- Posterior Fornix
Gut:	STO -- Stool

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.344	0.027	0.000	0.000	0.000	0.000	0.134	0.368	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.888	0.075	0.000	0.000	0.000	0.000	0.228	1.019	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.459	0.073	0.000	0.000	0.000	0.000	0.512	0.936	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	79.470	41.722	0.000	0.000	0.000	0.000	40.774	63.333	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.583	0.114	0.000	0.089	0.343	0.212	0.339	0.699	0.259	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.055	0.070	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.404	0.331	0.000	0.221	1.069	0.580	0.938	1.975	0.875	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.007	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.725	0.196	0.000	0.223	0.600	0.317	0.664	1.262	0.508	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.333	0.456	0.000	0.000
Prev(%)	86.667	61.951	0.000	47.891	61.381	70.238	66.667	86.131	58.881	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	10.345	6.011	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	1.966	0.255	0.199	0.150	0.191	0.607	0.165	0.531	0.207	0.000
10^thp	0.001	0.003	0.000	0.000	0.008	0.007	0.004	0.004	0.000	0.000
90^thp	5.872	0.504	0.541	0.573	0.448	1.601	0.383	1.119	0.617	0.000
Stdev	3.066	0.449	0.445	0.229	0.286	1.167	0.189	1.268	0.369	0.000
Prev(%)	89.189	91.176	79.070	82.857	100.000	94.000	93.939	90.323	72.500	0.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.455	0.054	0.344	0.061	0.027	0.000	0.061	0.441	0.462	0.264	0.002	0.001	0.000	0.000	0.000	0.000	0.006	0.002
10^thp	0.000	0.000	0.023	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.294	0.145	0.594	0.028	0.045	0.000	0.138	1.525	1.708	0.855	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.689	0.154	0.663	0.235	0.126	0.000	0.070	0.653	0.819	0.568	0.026	0.004	0.000	0.000	0.000	0.000	0.077	0.016
Prev(%)	83.333	41.162	91.667	11.765	21.011	0.000	62.500	56.250	80.000	53.052	0.901	4.167	0.000	0.000	0.000	0.000	0.505	2.364

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.104	0.016	0.004	0.013	0.099	0.065	0.100	0.158	0.119	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.327	0.058	0.008	0.045	0.337	0.224	0.238	0.514	0.434	0.000
Stdev	0.187	0.033	0.020	0.029	0.162	0.130	0.269	0.376	0.241	0.000
Prev(%)	54.545	28.571	11.688	29.870	59.740	45.455	49.351	59.740	49.351	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.594	0.143	0.023	0.067	0.240	0.171	0.225	0.414	0.193	0.001
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	1.501	0.358	0.021	0.188	0.669	0.450	0.512	0.917	0.526	0.000
Stdev	0.678	0.195	0.124	0.116	0.375	0.208	0.475	0.805	0.343	0.006
Prev(%)	87.838	68.919	13.514	55.405	68.243	75.676	72.297	80.405	56.757	2.098