HOMD ::Genus:Solobacterium

Genus: Solobacterium

Full Lineage: Bacteria; Bacillota; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Solobacterium Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

Lower rank member(s): [Species:Solobacterium moorei]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Solobacterium

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

HMP 16S RefSeq (V1-V3) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.047	0.010	0.000	0.032	0.278	0.277	0.443	0.349	0.359	0.008	0.000	0.000	0.000	0.011	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.016	0.008	0.017	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.114	0.030	0.000	0.085	0.573	0.666	0.953	0.846	0.860	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.143	0.028	0.000	0.058	0.440	0.368	0.482	0.354	0.369	0.050	0.000	0.000	0.000	0.056	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	45.033	28.477	0.000	54.795	82.550	77.692	90.476	90.667	94.194	7.667	0.000	0.000	0.000	5.991	0.000	0.000	0.000	0.000

HMP 16S RefSeq (V3-V5) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.024	0.000	0.027	0.000	0.027	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.084	0.000	0.083	0.000	0.079	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	0.000	0.000	0.048	0.000	0.068	0.000	0.056	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	0.000	0.000	34.527	0.000	39.875	0.000	47.932	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.120	0.082	0.317	0.040	0.128	0.584	0.355	0.260	0.524	0.002
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.006	0.031	0.030	0.013	0.002	0.000
90^thp	0.310	0.120	0.761	0.110	0.339	1.606	0.713	0.456	1.681	0.000
Stdev	0.297	0.273	0.904	0.047	0.167	0.782	0.607	0.399	0.808	0.007
Prev(%)	66.216	70.588	62.791	80.000	89.286	98.000	100.000	96.774	95.000	5.000

HMP Metaphlan (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.032	0.017	0.073	0.007	0.035	0.240	0.550	0.639	0.402	0.518	0.006	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.003	0.005
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.240	0.112	0.000	0.032	0.050	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.105	0.040	0.178	0.016	0.120	0.240	0.949	1.535	0.928	1.130	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.049	0.081	0.104	0.021	0.084	0.000	0.392	0.731	0.410	0.483	0.059	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.049	0.053
Prev(%)	54.167	22.727	50.000	11.765	32.447	100.000	100.000	68.750	92.000	96.244	0.901	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.505	2.909

Eren V1-V3 www.pnas.org

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.033	0.013	0.003	0.025	0.204	0.271	0.360	0.357	0.290	0.017
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.010	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.120	0.043	0.000	0.069	0.426	0.732	0.721	0.986	0.796	0.000
Stdev	0.065	0.029	0.013	0.056	0.407	0.396	0.508	0.447	0.349	0.144
Prev(%)	33.766	24.675	7.792	45.455	80.519	76.623	89.610	85.714	88.312	2.597

Eren V3-V5 www.pnas.org

No Notes

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: