HOMD ::Species:Haemophilus pittmaniae

Taxonomy: V4.2 | 16S rRNA RefSeq: V16.03 | Genomic RefSeq: V11.02 | Viruses: V1.2

Species: Haemophilus pittmaniae (HMT-946)

Download Options

Full Lineage: Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Haemophilus; Haemophilus pittmaniae Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

LINKS: Ecology Home | HMT-946: Body Sites Data | HMT-946: Taxon Description | Life Page: Haemophilus pittmaniae

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Eren V1-V3 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

Eren V3-V5 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.002	0.001	0.043	0.011	0.030	0.094	0.026	0.046	0.024	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.037	0.110	0.039	0.042	0.029	0.000
Stdev	0.016	0.004	0.361	0.061	0.173	0.570	0.111	0.204	0.171	0.003
Prev(%)	2.703	1.351	6.081	9.459	13.514	22.297	14.189	15.541	12.162	0.699

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V1-V3) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V3-V5) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.033	0.069	0.522	0.273	0.064	0.100	0.000	0.107	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.089	0.194	1.332	0.752	0.127	0.191	0.000	0.214	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.075	0.138	1.075	0.496	0.282	0.385	0.000	0.406	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	40.741	52.683	74.568	66.253	31.202	44.940	0.000	40.146	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.011	0.022	0.084	0.130	0.040	0.039	0.027	0.075	0.023	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.003	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.030	0.063	0.211	0.229	0.094	0.118	0.067	0.116	0.051	0.000
Stdev	0.022	0.041	0.138	0.305	0.051	0.066	0.067	0.280	0.050	0.000
Prev(%)	51.351	52.941	81.395	91.429	85.714	76.000	51.515	58.065	55.000	0.000

Human Microbiome Project Metaphlan (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.011	0.020	0.014	0.036	0.269	0.018	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.001
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.020	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.020	0.053	0.050	0.156	0.020	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.002	0.000	0.000	0.078	0.000	0.026	0.120	0.998	0.117	0.003	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.015
Prev(%)	0.000	0.253	0.000	0.000	7.181	100.000	25.000	18.750	20.000	15.258	0.450	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.727