HOMD ::Genus:Cloacibacterium

Genus: Cloacibacterium

Full Lineage: Bacteria; Bacteroidota; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Weeksellaceae; Cloacibacterium Each rank name is a link to abundance plots at that rank:

Lower rank member(s): [Species:Cloacibacterium normanense] [Species:Cloacibacterium sp. HMT-206]

LINKS: Ecology Home | Life Page: Cloacibacterium

Hide Legend

Oral:

SUBP-- Subgingival Plaque

SUPP -- Supragingival Plaque

PERIO -- Periodontal

AKE -- Attached Keratinized Gingiva

BMU -- Buccal Mucosa

HPA -- Hard Palate

SAL -- Saliva

THR -- Throat

PTO -- Palatine Tonsils

TDO -- Tongue Dorsum

Nasal:

ANA -- Anterior Nares

Skin:

LRC -- L_Retroauricular Crease

RRC -- R_Retroauricular Crease

LAF -- L_Antecubital Fossa

RAF -- R_Antecubital Fossa

Vaginal:

VIN -- Vaginal Introitus

MVA -- Mid Vagina

PFO -- Posterior Fornix

Gut:

STO -- Stool

Prev - Prevalence
10^thp - 10^th percentile
90^thp - 90^th percentile
ND - less than 0.001%

Show Legend

Eren V1-V3 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.004	0.003	0.143	0.289	0.060	0.176	0.155	0.071	0.008	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.115	0.910	0.110	0.121	0.107	0.096	0.015	0.000
Stdev	0.021	0.014	0.777	0.936	0.184	0.798	0.744	0.289	0.032	0.000
Prev(%)	9.091	6.494	18.182	28.571	23.377	20.779	18.182	18.182	11.688	0.000

Eren V3-V5 www.pnas.org (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	STO
Avg (%)	0.003	0.002	0.120	0.442	0.050	0.134	0.136	0.065	0.015	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.083	0.873	0.215	0.372	0.290	0.148	0.024	0.000
Stdev	0.015	0.010	0.782	2.578	0.127	0.413	0.525	0.193	0.094	0.000
Prev(%)	5.405	4.054	17.568	37.162	24.324	31.081	25.676	27.703	14.189	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V1-V3) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.003	0.243	0.330	0.055	0.133	0.083	0.077	0.009	0.034	0.032	0.028	0.173	0.134	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.009	0.284	1.210	0.183	0.232	0.200	0.127	0.012	0.104	0.022	0.034	0.302	0.246	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.009	1.018	0.816	0.155	0.530	0.291	0.447	0.047	0.095	0.186	0.161	0.749	0.679	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	13.245	35.664	48.630	26.846	26.154	27.381	26.000	14.194	28.000	15.230	18.414	22.414	23.502	0.000	0.000	0.000	0.000

Human Microbiome Project 16S RefSeq (V3-V5) (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	LAF	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.000	0.000	0.449	0.892	0.108	0.187	0.000	0.130	0.016	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.379	2.207	0.339	0.472	0.000	0.216	0.024	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.000	0.000	2.420	3.402	0.341	0.580	0.000	0.532	0.092	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
Prev(%)	0.000	0.000	23.951	34.988	26.343	33.036	0.000	28.224	15.328	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000

Dewhirst (35x9) (not published)

No Notes

	SUBP	SUPP	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA
Avg (%)	0.000	0.000	0.000	0.001	0.000	0.001	0.001	0.002	0.000	0.001
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.002	0.000	0.000
Stdev	0.002	0.000	0.002	0.003	0.000	0.005	0.003	0.009	0.001	0.002
Prev(%)	2.703	0.000	4.651	8.571	7.143	4.000	9.091	12.903	2.500	5.000

Human Microbiome Project Metaphlan (not published) (data from healthy subjects)

No Notes

	SUBP	SUPP	PERIO	AKE	BMU	HPA	SAL	THR	PTO	TDO	ANA	LRC	RRC	RAF	VIN	MVA	PFO	STO
Avg (%)	0.008	0.000	0.000	0.001	0.011	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.011	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.004	0.000
10^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.000	0.000
90^thp	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.480	0.000	0.000	0.000	0.000
Stdev	0.028	0.003	0.000	0.005	0.064	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.096	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.055	0.000
Prev(%)	8.333	1.263	0.000	5.882	6.649	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	2.703	0.000	0.000	100.000	0.000	0.000	1.010	0.182

Copyright 2007-2025, The Forsyth Institute
Hosted on Amazon AWS EC2

Body Site Legend: