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Taxonomy: V4.3   |  16S rRNA RefSeq: V16.03   |  Genomic RefSeq: V11.03   |  Viruses: V1.2

NCBIGenome Explorer: Aggregatibacter actinomycetemcomitans (GCA_008085365.1)

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NCBI Annotations for GCA_008085365.1
Genome Selected: Aggregatibacter actinomycetemcomitans
ContigsBases CDSrRNA tmRNAtRNA
27 2030108
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Region Protein-ID Type Genome
Viewer		 Range
(bp)		 Show Sequences
(length) NA / AA		 NCBI
Gene		 NCBI
GeneProduct
4001 VSEI01000016.1 gene open 8553-10460
4002 VSEI01000016.1 gene open 10759-13152 mrcB
4003 VSEI01000016.1 gene open 13198-13413
4004 VSEI01000016.1 gene open 13415-13756 erpA
4005 VSEI01000016.1 gene open 13887-14690 map
4006 VSEI01000016.1 gene open 14756-17347 glnD
4007 VSEI01000016.1 gene open 17423-18706 hemL
4008 VSEI01000016.1 gene open 18835-19908 wecA
4009 VSEI01000016.1 gene open 20075-20151
4010 VSEI01000016.1 gene open 20183-20258
4011 VSEI01000016.1 gene open 20261-20337
4012 VSEI01000017.1 gene open 3-1370 pssA
4013 VSEI01000017.1 gene open 1556-2632
4014 VSEI01000017.1 gene open 2698-2958
4015 VSEI01000017.1 gene open 3026-3721
4016 VSEI01000017.1 gene open 3834-4997
4017 VSEI01000017.1 gene open 5062-6141 fbaA
4018 VSEI01000017.1 gene open 6349-7491
4019 VSEI01000017.1 gene open 7484-8407
4020 VSEI01000017.1 gene open 8445-9263
4021 VSEI01000017.1 pseudogene open 9487-10314
4022 VSEI01000017.1 gene open 10508-10915
4023 VSEI01000017.1 gene open 10966-11382
4024 VSEI01000017.1 gene open 11516-12451 ftsX
4025 VSEI01000017.1 gene open 12460-13110 ftsE
4026 VSEI01000018.1 gene open 119-508 rplQ
4027 VSEI01000018.1 gene open 550-1539 rpoA
4028 VSEI01000018.1 gene open 1568-2188 rpsD
4029 VSEI01000018.1 gene open 2218-2607 rpsK
4030 VSEI01000018.1 gene open 2623-2979 rpsM
4031 VSEI01000018.1 gene open 3121-3234 rpmJ
4032 VSEI01000018.1 gene open 3260-4585 secY
4033 VSEI01000018.1 gene open 4589-5023 rplO
4034 VSEI01000018.1 gene open 5027-5206 rpmD
4035 VSEI01000018.1 gene open 5213-5713 rpsE
4036 VSEI01000018.1 gene open 5729-6082 rplR
4037 VSEI01000018.1 gene open 6096-6629 rplF
4038 VSEI01000018.1 gene open 6645-7037 rpsH
4039 VSEI01000018.1 gene open 7074-7379 rpsN
4040 VSEI01000018.1 gene open 7392-7931 rplE
4041 VSEI01000018.1 gene open 7949-8260 rplX
4042 VSEI01000018.1 gene open 8271-8642 rplN
4043 VSEI01000019.1 gene open 37-113
4044 VSEI01000019.1 gene open 147-223
4045 VSEI01000019.1 gene open 380-1237 folD
4046 VSEI01000019.1 gene open 1326-2969 groL
4047 VSEI01000019.1 gene open 3090-3380
4048 VSEI01000019.1 gene open 3467-3949 fxsA
4049 VSEI01000019.1 gene open 4179-5597 aspA
4050 VSEI01000019.1 gene open 5779-6816
4051 VSEI01000019.1 gene open 6788-6985
4052 VSEI01000019.1 gene open 7723-8328
4053 VSEI01000020.1 gene open 142-1311 nlpD
4054 VSEI01000020.1 gene open 1328-1519
4055 VSEI01000020.1 gene open 1534-2109
4056 VSEI01000020.1 gene open 2137-2877 surE
4057 VSEI01000020.1 gene open 2910-3920 truD
4058 VSEI01000020.1 gene open 3917-4396 ispF
4059 VSEI01000020.1 gene open 4393-5088 ispD
4060 VSEI01000020.1 gene open 5088-5366 ftsB
4061 VSEI01000020.1 gene open 5518-6192
4062 VSEI01000020.1 gene open 6195-6869
4063 VSEI01000021.1 gene open 323-1552
4064 VSEI01000021.1 gene open 1682-2365
4065 VSEI01000021.1 gene open 2381-3652 nadR
4066 VSEI01000021.1 pseudogene open 3703-3953
4067 VSEI01000021.1 gene open 3972-4217 tusA
4068 VSEI01000021.1 pseudogene open 4194-4576
4069 VSEI01000021.1 gene open 4607-4822
4070 VSEI01000021.1 gene open 4841-6304
4071 VSEI01000021.1 gene open 6304-6816 hemG
4072 VSEI01000022.1 gene open 82-936
4073 VSEI01000022.1 gene open 947-2008
4074 VSEI01000022.1 gene open 2010-3476
4075 VSEI01000022.1 gene open 3556-3774
4076 VSEI01000022.1 pseudogene open 3749-4075
4077 VSEI01000022.1 gene open 4104-4586
4078 VSEI01000023.1 gene open 1-106 rrf
4079 VSEI01000023.1 gene open 371-3412
4080 VSEI01000024.1 gene open 103-540
4081 VSEI01000024.1 gene open 540-1574
4082 VSEI01000024.1 gene open 1684-2025
4083 VSEI01000024.1 pseudogene open 2160-2365
4084 VSEI01000025.1 gene open 153-1696
4085 VSEI01000026.1 gene open 1-1150 tuf
4086 VSEI01000027.1 gene open 1-645
4087 VSEI01000001.1 sequence_feature open 97710-97839
4088 VSEI01000002.1 riboswitch open 123249-123293
4089 VSEI01000002.1 riboswitch open 200750-200837
4090 VSEI01000005.1 riboswitch open 92111-92259
4091 VSEI01000008.1 riboswitch open 45532-45715
4092 VSEI01000010.1 riboswitch open 61954-62102
4093 VSEI01000001.1 tRNA open 58442-58518 tRNA-Met
4094 VSEI01000001.1 tRNA open 68147-68220 tRNA-Cys
4095 VSEI01000001.1 tRNA open 68229-68304 tRNA-Gly
4096 VSEI01000001.1 tRNA open 75659-75748 tRNA-Ser
4097 VSEI01000001.1 tRNA open 123714-123789 tRNA-Lys
4098 VSEI01000001.1 tRNA open 123816-123891 tRNA-Lys
4099 VSEI01000001.1 tRNA open 123917-123993 tRNA-Lys
4100 VSEI01000001.1 tRNA open 185976-186052 tRNA-Asp
4101 VSEI01000001.1 tRNA open 186075-186151 tRNA-Asp
4102 VSEI01000001.1 SRP_RNA open 295920-296018 ffs signal recognition particle sRNA small type
4103 VSEI01000002.1 tRNA open 22093-22168 tRNA-Gly
4104 VSEI01000002.1 tRNA open 217672-217748 tRNA-Met
4105 VSEI01000002.1 tRNA open 217754-217838 tRNA-Leu
4106 VSEI01000002.1 tRNA open 217868-217942 tRNA-Gln
4107 VSEI01000002.1 tRNA open 217980-218054 tRNA-Gln
4108 VSEI01000002.1 tRNA open 246548-246624 tRNA-Met
4109 VSEI01000003.1 tRNA open 95-170 tRNA-Thr
4110 VSEI01000003.1 tRNA open 174-248 tRNA-Gly
4111 VSEI01000003.1 tRNA open 289-373 tRNA-Tyr
4112 VSEI01000003.1 tRNA open 404-479 tRNA-Thr
4113 VSEI01000003.1 tRNA open 29382-29458 tRNA-Ile
4114 VSEI01000003.1 tRNA open 101534-101619 tRNA-Leu
4115 VSEI01000003.1 tRNA open 130897-130983 tRNA-Leu
4116 VSEI01000003.1 tRNA open 186686-186761 tRNA-Lys
4117 VSEI01000003.1 tRNA open 186814-186900 tRNA-Leu
4118 VSEI01000003.1 tRNA open 186902-186977 tRNA-Gly
4119 VSEI01000004.1 ncRNA open 138209-138392 ssrS 6S RNA
4120 VSEI01000005.1 tRNA open 121712-121787 tRNA-Ala
4121 VSEI01000005.1 tRNA open 123597-123672 tRNA-Val
4122 VSEI01000005.1 tRNA open 123711-123786 tRNA-Val
4123 VSEI01000005.1 tRNA open 123814-123889 tRNA-Val
4124 VSEI01000006.1 tRNA open 29867-29942 tRNA-Asn
4125 VSEI01000006.1 tRNA open 103524-103609 tRNA-Leu
4126 VSEI01000008.1 tRNA open 76469-76545 tRNA-Arg
4127 VSEI01000008.1 tRNA open 76600-76676 tRNA-Arg
4128 VSEI01000008.1 tRNA open 76694-76787 tRNA-Ser
4129 VSEI01000009.1 tRNA open 81922-81997 tRNA-Asn
4130 VSEI01000009.1 tRNA open 82002-82077 tRNA-Phe
4131 VSEI01000010.1 RNase_P_RNA open 25935-26323 rnpB RNase P RNA component class A
4132 VSEI01000010.1 tRNA open 81718-81794 tRNA-Val
4133 VSEI01000012.1 rRNA open 61-176 rrf 5S ribosomal RNA
4134 VSEI01000012.1 tRNA open 185-261 tRNA-Asp
4135 VSEI01000012.1 tRNA open 296-371 tRNA-Trp
4136 VSEI01000012.1 tRNA open 18617-18706 tRNA-Ser
4137 VSEI01000013.1 tmRNA open 11584-11949 ssrA transfer-messenger RNA
4138 VSEI01000013.1 tRNA open 77195-77289 tRNA-Sec
4139 VSEI01000016.1 tRNA open 20075-20151 tRNA-Arg
4140 VSEI01000016.1 tRNA open 20183-20258 tRNA-His
4141 VSEI01000016.1 tRNA open 20261-20337 tRNA-Pro
4142 VSEI01000019.1 tRNA open 37-113 tRNA-Arg
4143 VSEI01000019.1 tRNA open 147-223 tRNA-Pro
4144 VSEI01000023.1 rRNA open 1-106 rrf 5S ribosomal RNA
4145 VSEI01000023.1 rRNA open 371-3412 23S ribosomal RNA
4146 VSEI01000025.1 rRNA open 153-1696 16S ribosomal RNA
4147 VSEI01000001.1 region open 1-309081
4148 VSEI01000002.1 region open 1-284219
4149 VSEI01000003.1 region open 1-213995
4150 VSEI01000004.1 region open 1-166983
4151 VSEI01000005.1 region open 1-130418
4152 VSEI01000006.1 region open 1-115480
4153 VSEI01000007.1 region open 1-106317
4154 VSEI01000008.1 region open 1-104087
4155 VSEI01000009.1 region open 1-102503
4156 VSEI01000010.1 region open 1-100858
4157 VSEI01000011.1 region open 1-90758
4158 VSEI01000012.1 region open 1-78584
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4163 VSEI01000017.1 region open 1-13264
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4170 VSEI01000024.1 region open 1-2365
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4173 VSEI01000027.1 region open 1-645