Abundance by Habitat
Download Options
[Select a Rank:]
The abundance values are taken by averaging the available relative abundance data from the four studies:
Eren (2014) V1-V3 and V3-V5 HMP RefSeq (V1-V3 and V3-V5) Data and Dewhirst (unpublished)
| Subgingival Plaque (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Supragingival Plaque (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Attached Keratinized Gingiva (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Buccal Mucosa (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Hard Palate (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Hyphomicrobiales | 0.001 |
| Sum: | 0.010 |
| Saliva (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Hyphomicrobiales | 0.025 |
| Sum: | 0.250 |
| Throat (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Hyphomicrobiales | 0.004 |
| Sum: | 0.040 |
| Palatine Tonsils (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Hyphomicrobiales | 0.006 |
| Sum: | 0.060 |
| Tongue Dorsum (oral)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Anterior Nares (nasal)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Hyphomicrobiales | 0.034 |
| Sum: | 0.340 |
| L_Retroauricular Crease (skin)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Hyphomicrobiales | 0.041 |
| Sum: | 0.410 |
| R_Retroauricular Crease (skin)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Hyphomicrobiales | 0.077 |
| Sum: | 0.770 |
| L_Antecubital Fossa (skin)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Hyphomicrobiales | 0.538 |
| Sum: | 5.380 |
| R_Antecubital Fossa (skin)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Hyphomicrobiales | 0.370 |
| Sum: | 3.700 |
| Vaginal Introitus (vaginal)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Hyphomicrobiales | 0.003 |
| Sum: | 0.030 |
| Mid Vagina (vaginal)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Posterior Fornix (vaginal)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
| Stool (gut)(all) | |
|---|---|
| % Abund | |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Hyphomicrobiales | 0.000 |
| Sum: | 0.000 |
